[VIP第1年] 指数:3
确保重组EGFP（增强型绿色荧光蛋白）在实验中的稳定性和活性，可以采取以下措施：1.**适当的储存条件**：重组EGFP通常以冻干粉形式提供，应在-20°C至-80°C的低温条件下储存，以保持其稳定性。避免反复冻融，因为这可能导致蛋白质结构的破坏和活性的丧失。2.**正确的复溶方法**：在无菌条件下，使用推荐的溶剂（通常是无菌去离子水或适当的缓冲液）复溶EGFP，并避免使用含有蛋白酶或氧化剂的溶液。3.**避免光照**：EGFP对光照敏感，尤其是在紫外和蓝光下。在处理和储存时应避光，使用遮光容器或在低光照条件下操作。4.**使用保护剂**：在某些情况下，添加蛋白稳定剂（如甘油、蔗糖或BSA）可以提高EGFP的稳定性。5.**避免极端pH**：EGFP的活性和稳定性可能受到pH值的影响。在实验中使用接近其等电点pH值的缓冲系统，通常是中性或略偏碱性的条件。6.**控制温度**：避免将EGFP暴露在极端温度下，尤其是在高温条件下，因为这可能导致蛋白质变性。7.**避免物理剪切力**：在操作过程中，避免剧烈搅拌或超声处理，因为这些可能会导致蛋白质结构的破坏。在50 μL的反应体系中，建议使用1.5 μL的5× PCR Enhancer（如果需要）和0.5 μL的Phusion DNA Polymerase。Rat Eotaxin-2/CCL24
PreScissionProtease（PSP）是一种在蛋白质纯化和分析中使用的酶，具有以下特点：1.**特异性识别**：PSP能在低温（4°C）下特异性识别八肽序列Leu-Glu-Val-Leu-Phe-Gln-Gly-Pro或五肽序列Leu-Phe-Gln-Gly-Pro，并在Gln和Gly之间进行酶切。2.**应用**：PSP常用于去除融合蛋白中的GlutathioneS-transferase(GST)、His等标签，有助于纯化目的蛋白。3.**纯度高**：PSP的纯度达到95%以上，确保了实验的准确性和重复性。4.**稳定性好**：PSP在含有50%甘油的储存缓冲液中，-80℃长期储存，有效期2年；小量分装-20℃保存，有效期6个月。5.**酶活定义**：在5℃条件下反应16小时，能够切割100μg的GST标签蛋白达90%以上所需的酶量定义为一个活性单位。6.**兼容性强**：PSP的酶切体系中可以兼容1%TritonX-100、Tween-20或NP-40，10mMEDTA和500mMNaCl。7.**注意事项**：某些化合物如100mMZnCl2、4mMAEBSF和100μMChymostatin会抑制PSP的酶活性50%以上。8.**优化酶切效率**：建议进行预实验摸索实验浓度，实际操作中，建议酶用量1:25-1:100U/μg融合蛋白。Hyaluronidase 透明质酸酶UDG在结构上属于单功能DNA糖基化酶，它通过沿着DNA链滑动，识别尿嘧啶分子，进行碱基切除。
PreScissionProtease（PSP）在去除融合蛋白标签时，对目的蛋白的纯度和活性的影响通常是积极的，具体表现在以下几个方面：1.**小化污染**：由于PSP具有高度的特异性，它在特定的肽键处切割，从而减少了非特异性切割可能导致的蛋白质片段，这有助于保持目的蛋白的纯度。2.**减少蛋白质修饰**：PSP的特异性切割有助于避免在切割过程中对目的蛋白引入额外的修饰，如磷酸化或糖基化，这些修饰可能会影响蛋白质的活性和稳定性。3.**保持活性**：如果融合蛋白标签的设计和切割位点选择得当，PSP切割后的目的蛋白通常能够保持其原有的生物活性。切割位点通常位于标签和目的蛋白之间，这样切割后不会在目的蛋白上留下额外的氨基酸，从而减少了对蛋白质结构和功能的影响。4.**提高纯度**：PSP切割后，可以通过亲和层析等方法将标签、PSP以及未切割的融合蛋白分离，从而获得高纯度的目的蛋白。5.**便于后续分析**：去除标签后的目的蛋白更易于进行后续的质谱分析、晶体学研究或其他生物化学分析，因为去除了可能干扰分析的标签部分。6.**稳定性**：在某些情况下，融合蛋白的标签可能有助于稳定目的蛋白的构象，因此在去除标签后，需要适当处理以维持目的蛋白的稳定性。
EndoS糖苷内切酶S（Endo-S）的特异性主要体现在其对糖蛋白的糖链结构的识别和切割能力上。以下是Endo-S的一些关键特异性特点：1.**糖链识别**：Endo-S能够特异性识别糖链结构中的某些特定序列或结构，尤其是N-连接糖链的壳二糖重要结构。2.**切割位点**：Endo-S在糖链的特定位点进行切割，通常是在N-乙酰葡糖胺（GlcNAc）和天冬酰胺之间的β-N-糖苷键。3.**不影响抗原性**：Endo-S的切割位点选择性高，不会破坏糖蛋白的抗原决定簇，因此在某些应用中可以保持糖蛋白的免疫原性。4.**应用多样性**：Endo-S可以用于多种糖蛋白的去糖基化，包括抗体和其他具有N-连接糖链的蛋白质。5.**研究和药物开发**：在研究糖蛋白的结构和功能时，Endo-S提供了一种工具来研究糖链对蛋白质性质的影响。此外，在药物开发中，Endo-S用于制备糖链定点ADC化合物，通过精确控制药物与抗体的连接点，提高药物的疗效和减少副作用。6.**兼容性**：Endo-S对多样化的LacNAc修饰显示出良好的兼容性，可以接受不同生物正交基团、荧光基团等衍生物作为底物，实现抗体糖基化修饰。7.**高效性**：Endo-S在催化糖链转移或切割反应中表现出高效性，有助于实现高效获得功能修饰的糖工程抗体。泛素连接酶E3识别特定的靶蛋白，并促进E2上的泛素转移到靶蛋白的赖氨酸残基上，形成泛素化标记。
SpCas9蛋白（来自化脓性链球菌的Cas9蛋白）在基因编辑中的主要作用是作为核酸酶，能够精确地切割目标DNA序列。以下是SpCas9在基因编辑中的几个关键步骤和作用：1.**识别和结合**：SpCas9蛋白与一个单导向RNA（sgRNA）结合，形成RNP复合物。这个复合物能够识别并结合到基因组中与sgRNA互补的特定DNA序列。2.**PAM序列识别**：SpCas9需要一个称为原间隔子相邻基序（PAM）的特定序列作为识别目标DNA的先决条件。对于SpCas9，这个PAM序列通常是5'-NGG-3'。3.**DNA切割**：一旦RNP复合物与目标DNA结合，SpCas9就会在PAM序列的3个碱基对的上游位置切割DNA双链，产生一个双链断裂（DSB）。4.**引发DNA修复**：DNA双链断裂触发细胞的DNA修复机制，包括同源定向修复（HDR）和非同源末端连接（NHEJ）。研究人员可以利用这些修复机制来插入、删除或替换特定的DNA序列。5.**基因修改**：通过HDR，可以在断裂的DNA两端引入特定的DNA模板，从而实现精确的基因编辑。而NHEJ通常会导致小的插入或缺失（indel），这可以用来产生基因的敲除或敲入。6.**提高编辑效率**：为了提高SpCas9的编辑效率，研究人员可能会使用优化的sgRNA设计、蛋白质工程或嵌合融合蛋白等策略。
泛素蛋白是一种在真核细胞中存在的小分子蛋白质，由76个氨基酸残基组成，具有高度的保守性。Rat Eotaxin-2/CCL24
EndoS酶在抗体药物偶联物（ADCs）研究中的具体应用主要体现在糖链定点偶联技术方面。根据上海药物研究所的研究进展，EndoS酶被用于实现定点ADC化合物的“一步”制备，这是一种新颖的糖链定点ADC制备策略。该策略利用了新颖截短型糖结构的药物-连接子和野生型糖苷内切酶EndoS2，将小分子细胞毒药物直接定点连接到抗体糖基化位点，从而克服了传统糖链定点ADC制备策略的限制。具体来说，研究人员通过筛选发现，EndoS2酶可以将二糖底物LacNAc转移至去糖抗体N297位糖基化位点，并且LacNAc半乳糖6号位唾液酸化修饰不影响EndoS2的转糖基化活性。这一发现使得EndoS2和LacNAc的组合可以直接实现野生型抗体的糖基化改造，且EndoS2对多样化LacNAc修饰的兼容性，可以高效获得多样性功能修饰的岩藻糖化或去岩藻糖化的糖工程抗体。此外，研究人员还利用叠氮化修饰的LacNAc底物实现了抗体糖基化位点的“一步”叠氮化修饰，并通过点击化学反应偶联药物-连接子，实现了“两步”制备得到定点ADC化合物。
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